ACTUALIZACIÓN: hemos corregido este bug, por lo que ya no debería suceder en equipos actualizados o nuevas revisiones actuales de la ISO. Hemos cambiado, tal como se explica en este hilo, la configuración predeterminada, aunque sólo para Quirinux. Esto quiere decir que el bug se puede seguir presentando en otras distribuciones, a menos que VLC incorpore también nuestras modificaciones.
La siguiente solución es válida también para esto:
https://foro.quirinux.org/forums/topic/vlc-reproduce-el-video-entrecortado-solucion/